El puerto de Topolobampo, tiene un canal de navegación principal muy extenso el cual se encuentra señalado por 20 boyas metálicas que delimitan la plantilla para la navegación y operación.
Se tienen, además, tres sistemas de enfilamiento ubicados estratégicamente en tierra, se tienen seis balizas de situación en los cuales se señalan áreas cercanas al canal.
La boya recalada se localiza aproximadamente a 25 kms. del puerto comercial, tiene un racon con cobertura de 20 mm.
Faro cerro partido:
Localizado al sureste del puerto óptica giratoria tipo aerofaro - faro de 910 mm.
Boya recalada:
Localizada a 20 millas del puerto, esta es la primera señal de recalada de todas las embarcaciones que se aproximan al puerto, en esta boya esta instalado un racon con banda de "X" y "S" , de frecuencia ágil y respuesta azimutal de 360° con cobertura de 20 m.n.
Baliza de Posición Farallón:
Localizado mar adentro del cerro del mismo nombre a 45 millas al sureste del puerto.
Primer enfilamiento:
Sobre el canal de navegación de acceso al puerto, se cuenta con la baliza anterior de Baviri, localizado al este del puerto en el cerro de Baviri y la baliza posterior Iturbe localizado al noroeste del puerto.
Segundo enfilamiento:
Sobre el canal de navegación de acceso al puerto, se cuenta con la baliza anterior punta prieta y la posterior punta copa localizadas al sureste del puerto.
Tercer enfilamiento:
Sobre el canal de navegación de acceso al puerto se cuenta con la baliza anterior punta copa y la posterior localizadas ambas al sureste del puerto en la playa del mismo nombre.
Se cuenta con seis balizas de posición las cuales se localizan en áreas preventivas de tierra firme adyacentes al canal de navegación. Además se cuenta con 23 boyas que señalan ambos extremos del canal de navegación.
Obras de protección:
El puerto de Topolobampo, por sus condiciones geográficas, no requiere obras de protección, ya que se ubica en una Bahía natural que lleva su mismo nombre.
